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A energia potencial é definida pela geometria de uma estrutura nativa e por um mapa que determina os contatos nativos. Foram analisados mapas com amplo uso na literatura — CO, SCM, CSU e um mapa adaptado a partir do Frustratômetro — aplicados a três proteínas distintas. Os resultados mostram robustez do SBM na troca de mapas, mas indicam perdas de informação na simplificação SBM-Cα e dependência da capacidade de capturar estados intermediários.",{"@graph":59,"@context":116},[60,77,99],{"@type":61,"itemListElement":62},"BreadcrumbList",[63,68,71,74],{"item":64,"name":65,"@type":66,"position":67},"https://docshare.wps.com","Home","ListItem",1,{"item":69,"name":9,"@type":66,"position":70},"https://docshare.wps.com/pt/document/",2,{"item":72,"name":35,"@type":66,"position":73},"https://docshare.wps.com/pt/document/pesquisa-e-relatórios/",3,{"item":75,"name":55,"@type":66,"position":76},"https://docshare.wps.com/pt/document/the-impact-of-map-selection-on-protein-folding-study-masters-dissertation/146781/",4,{"url":75,"name":55,"@type":78,"image":79,"author":84,"headline":55,"publisher":87,"fileFormat":90,"inLanguage":53,"description":57,"dateModified":91,"datePublished":92,"encodingFormat":90,"isAccessibleForFree":93,"interactionStatistic":94},"DigitalDocument",{"url":80,"@type":81,"width":82,"height":83},"https://docshare.wps.com/thumbnails/the-impact-of-map-selection-on-protein-folding-study-masters-dissertation/146781.png","ImageObject",300,407,{"name":85,"@type":86},"Maeve","Person",{"url":64,"name":88,"@type":89},"DocShare","Organization","application/pdf","2026-09-20","2026-08-26",true,{"@type":95,"interactionType":96,"userInteractionCount":98},"InteractionCounter",{"@type":97},"ViewAction",6,{"@type":100,"mainEntity":101},"FAQPage",[102,108,112],{"name":103,"@type":104,"acceptedAnswer":105},"Qual é o objetivo central do trabalho?","Question",{"text":106,"@type":107},"Avaliar como a escolha do mapa de contato afeta o estudo do enovelamento de proteínas dentro do Modelo Baseado em Estrutura (SBM).","Answer",{"name":109,"@type":104,"acceptedAnswer":110},"Quais mapas de contato foram estudados?",{"text":111,"@type":107},"Foram estudados o mapa de corte CO, o Mapa de Contatos de Sombra (SCM), o Mapa de Contatos Estruturais (CSU) e um quarto mapa adaptado a partir do Frustratômetro (Frt).",{"name":113,"@type":104,"acceptedAnswer":114},"O que os resultados indicam sobre a simplificação SBM-Cα?",{"text":115,"@type":107},"A simplificação SBM-Cα pode causar perdas significativas de informação, afetando a capacidade de os mapas avaliarem corretamente estados intermediários previstos para a Barnase.","https://schema.org",{"og:url":75,"og:type":118,"og:title":55,"og:site_name":88,"og:description":57},"article",{"robots":120,"canonical":75},"index,follow",{"doc_id":122,"site_id":52},146781,1787750343,{"code":4,"msg":5,"data":125},{"doc_id":122,"user_id":126,"nickname":85,"user_avatar":127,"doc_module":4,"category_id":34,"category_name":35,"doc_title":55,"doc_description":57,"doc_content":128,"file_id":129,"file_url":130,"file_type":131,"file_size":132,"view_count":98,"is_deleted":4,"is_public":67,"is_downloadable":67,"audit_status":67,"page_count":133,"language":134,"language_code":53,"site_id":52,"html_lang":53,"table_of_contents":135,"faqs":136,"seo_title":137,"seo_description":57,"update_tm":123,"read_time":138},5909877438554,"https://ap-avatar.wpscdn.com/avatar/5600025385ad2bf12a7?_k=1778553567797529272","Larissa Maria Ferreira Adolfo  \n# A influência da escolha do mapa no estudo do enovelamento de proteínas\n\nutilização do modelos baseados em estrutura  \nSão José do Rio Preto  \nLarissa Maria Ferreira Adolfo  \n# A influência da escolha do mapa no estudo do enovelamento de proteínasutilização do modelos baseados em estrutura\n\nDissertação apresentada como parte dosrequisitos para obtenção do título de Mestreem Biofísica Molecular, junto ao Programa dePós-Graduação em Biofísica Molecular, doInstituto de Biociências, Letras e CiênciasExatas da Universidade Estadual Paulista“Júlio de Mesquita Filho”, Câmpus de SãoJosé do Rio Preto.  \nFinanciadora: CAPES  \nOrientador: Prof. Dr. Leandro Cristante deOliveira  \nSão José do Rio Preto  \nAdolfo, Larissa Maria Ferreira.  \nA239i A influência da escolha do mapa no estudo do enovelamento deproteínas utilizando modelo baseado em estrutura / Larissa MariaFerreira Adolfo - - São José do Rio Preto, 2023  \n86 f.  \nDissertação (mestrado) - Universidade Estadual Paulista (Unesp),Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas, São José do Rio Preto  \nOrientador: Leandro Cristante de Oliveira  \n1.Mapa de Contato. 2. Enovelamento de Proteínas. 3. Biofísica. I.Título.  \nSistema de geração automática de fichas catalográficas da Unesp. Biblioteca do Instituto deBiociências, Letras e Ciências Exatas, São José do Rio Preto. Dados fornecidos pelo autor(a) .  \nEssa ficha não pode ser modificada.  \nLarissa Maria Ferreira Adolfo  \nA influência da escolha do mapa no estudo do enovelamento de proteínasutilização do modelos baseados em estrutura  \nDissertação apresentada como parte dosrequisitos para obtenção do título de Mestreem Biofísica Molecular, junto ao Programa dePós-Graduação em Biofísica Molecular, doInstituto de Biociências, Letras e CiênciasExatas da Universidade Estadual Paulista“Júlio de Mesquita Filho”, Câmpus de SãoJosé do Rio Preto.  \nFinanciadora: CAPES:  \nComissão Examinadora  \nProf. Dr. Leandro Cristante de OliveiraUNESP – Câmpus de São José do Rio PretoOrientador  \nProf. Dr. Laurent Emmanuel Dardenne  \nLNCC – Laboratório Nacional de Computação Científica  \nProf. Dr. Rui Travasso  \nCFisUC – Centro de Física da Universidade de Coimbra  \nSão José do Rio Preto04 de Agosto 2023  \n# AGRADECIMENTOS\n\nInicialmente agradeço a mim por todo esforço e dedicação. Aos meus pais, irmã,sobrinha e minhanamorada Jennifer por não deixarem que eu esqueça dos meus objetivos devida e nem que eu desanime.  \nÀs meninas darepública Tilangas (2022/2023), por me fazeremsair do\"casulo\" e aospessoaldasala 42 (2022/2023) por todo apoio, discussões e cafés. Também à minhaparceiradesala, ou o “Lari-Verso”. À Carol, por ser minha amiga desde a graduação e por sempre meapoiar. Ao meu psicólogo e ao departamento de Física e a UNESP.  \nAo meu grupo depesquisa ‘DoPreDin’: A Carol e Raphael, por toda a discussão eapoio, sem vocês eu teria surtado. E principalmente ao meu orientador Leandro, por toda apaciência, ensinamento, confiança e amizade gerada nesse tempo.  \nÀ banca examinadora, pela disposição e contribuição para este trabalho.  \nEsta pesquisa tornou-se possível também graças aos recursos computacionaisdisponibilizados pelo Núcleo de Computação Científica (NCC/GridUNESP) da UniversidadeEstadual Paulista (UNESP) .  \nO presente trabalho também foi realizado com apoio da Coordenação deAperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Códigode Financiamento001 (88882.461721/2019-01), à qualagradeço.  \n“A energia que move o mundo,é a que deixa o caixa eletrônico ligado”  \n- Canal “O Algoritmo da Imagem”  \n# RESUMO\n\nUma das formas de estudar o enovelamento proteico é utilizando o Modelo Baseado emEstrutura (do inglês: Structure Based Model, SBM) . Sua energia potencial é determinadapelas propriedades geométricas de uma dada estrutura nativa e um mapa que define oscontatos nativos. Esses mapas de contato nativo são responsáveis pela representação dasinterações de resduos 􀕑􀕒 que estabeleceminteraçõesatrativas, estabi","cbCaibhe4IH0qx4G","https://ap.wps.com/l/cbCaibhe4IH0qx4G","pdf",6055345,86,"Portuguese","# A influência da escolha do mapa no estudo do enovelamento de proteínas\n## Agradecimentos\n## Resumo\n## Abstract","[{\"question\":\"Qual é o objetivo central do trabalho?\",\"answer\":\"Avaliar como a escolha do mapa de contato afeta o estudo do enovelamento de proteínas dentro do Modelo Baseado em Estrutura (SBM).\"},{\"question\":\"Quais mapas de contato foram estudados?\",\"answer\":\"Foram estudados o mapa de corte CO, o Mapa de Contatos de Sombra (SCM), o Mapa de Contatos Estruturais (CSU) e um quarto mapa adaptado a partir do Frustratômetro (Frt).\"},{\"question\":\"O que os resultados indicam sobre a simplificação SBM-Cα?\",\"answer\":\"A simplificação SBM-Cα pode causar perdas significativas de informação, afetando a capacidade de os mapas avaliarem corretamente estados intermediários previstos para a Barnase.\"}]","A influência da escolha do mapa no estudo do enovelamento de proteínas - Dissertação de mestrado | PDF",132]